Mudanças entre as edições de "Belousov-Zhabotinsky"
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− | A reação de Belousov-Zhabotinsky<ref name=Sayama260>H. Sayama, "Introduction to the Modeling and Analysis of Complex Systems", p. 287. Open SUNY Textbooks, Geneseo, NY, 2015.</ref> <ref name=Paper> | + | A reação de Belousov-Zhabotinsky<ref name=Sayama260>H. Sayama, "Introduction to the Modeling and Analysis of Complex Systems", p. 287. Open SUNY Textbooks, Geneseo, NY, 2015.</ref> <ref name=Paper>Harzola-Flores J.A., García E., Rojas J.F, Spatial and temporal dynamics of Belousov-Zhabotinsky reaction: A STEM approach (2020), Revista Mexicana de Física E 17 (2) 178–190 </ref> (BZ) consiste em uma família de reações químicas oscilatórias descobertas inicialmente por Belousov, e posteriormente analisadas por Zhabotinsky. A reação consiste em 3BrO<sub>3</sub><sup>−</sup> + 5CH<sub>2</sub>(CO<sub>2</sub>H)<sub>2</sub> + 3H<sup>+</sup> → 3BrCH(CO<sub>2</sub>H)<sub>2</sub> + 4CO<sub>2</sub> + 5H<sub>2</sub>O + 2CH<sub>2</sub>O<sub>2</sub>, e demonstra um comportamento oscilatório não linear até atingir o equilíbrio químico. A interação entre a reação e a difusão dos produtos químicos no espaço resultará na auto-organização de ondas viajantes dinâmicas. Seu mecanismo original, foi descrito através de 27 espécies químicas e um total de 80 reações. |
− | [[Arquivo:BZReaction.gif|thumb|center|none|alt=Alt text|Reação de Belousov-Zhabotinsky em uma placa de Petri.|480px]] | + | [[Arquivo:BZReaction.gif|thumb|center|none|alt=Alt text|Reação de Belousov-Zhabotinsky em uma placa de Petri.<ref name=BZGif>https://gfycat.com/uk/discover/belousov-zhabotinsky-reaction-gifs</ref>|480px]] |
== Oregonator == | == Oregonator == | ||
− | Oregonator<ref name=Paper> | + | Oregonator<ref name=Paper>Harzola-Flores J.A., García E., Rojas J.F, Spatial and temporal dynamics of Belousov-Zhabotinsky reaction: A STEM approach (2020), Revista Mexicana de Física E 17 (2) 178–190 </ref> é um modelo matemático utilizado para descrever de forma mais simples a dinâmica da reação BZ, desenvolvido por Field e Noyes (1974). Foi um modelo não espacial originalmente composto por três variáveis de estado, onde posteriormente, vemos que tornam-se apenas duas. O mecanismo é, inicialmente composto por cinco etapas irreversíveis, onde, A = 3BrO<sub>3</sub> <sup>-</sup>, B = 5CH<sub>2</sub>(COOH)<sub>2</sub>; 2HCOOH, 3BrCH(COOH)<sub>2</sub> (no geral, estas e demais espécies orgânicas); P = HOBr; X = HBrO<sub>2</sub>; Y = Br<sup>-</sup>; Z = forma oxidada do catalisador e f é o coeficiente estequiométrico. Observamos também. suas respectivas equações de taxa, onde v é a taxa da reação e k<sub>i</sub> corresponde às constantes de taxa de reação: |
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− | | || || A + Y || <math>\longrightarrow</math> || X + P | + | | || || A + Y || <math>\longrightarrow</math> || X + P || || || || || || || || || || || || || || || v<sub>1</sub> = k<sub>1</sub> [A][Y] |
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− | | || || X + Y || <math>\longrightarrow</math> || 2 P | + | | || || X + Y || <math>\longrightarrow</math> || 2 P || || || || || || || || || || || || || || || v<sub>2</sub> = k<sub>2</sub> [X][Y] |
− | |- | + | |- |
− | | || || A + X || <math>\longrightarrow</math> || 2 X + 2 Z | + | | || || A + X || <math>\longrightarrow</math> || 2 X + 2 Z || || || || || || || || || || || || || || || v<sub>3</sub> = k<sub>3</sub> [A][X] |
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| align="right"|2 X | | align="right"|2 X | ||
− | | <math>\longrightarrow</math> || A + P | + | | <math>\longrightarrow</math> || A + P || || || || || || || || || || || || || || || v<sub>4</sub> = k<sub>4</sub> [X]<sup>2</sup> |
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| align="right" | B + Z | | align="right" | B + Z | ||
− | | <math>\longrightarrow</math> || <math>\frac{1}{2}f</math> Y | + | | <math>\longrightarrow</math> || <math>\frac{1}{2}f</math> Y || || || || || || || || || || || || || || || v<sub>5</sub> = k<sub>5</sub> [B][Z] |
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+ | Para construir o modelo Oregonator, é necessário supor que as concentrações de A e B permaneçam constantes (estão associadas às concentrações iniciais dos precursores). Posteriormente, deve-se aplicar as técnicas padrão de cinética química para obter o modelo dinâmico considerando X, Y e Z como variáveis dinâmicas, assumindo que as reações químicas são elementares, ou seja, os coeficientes estequiométricos coincidem com a potência das variáveis dinâmicas. Considerando <math>\tau</math> como o tempo, vemos as seguintes equações de velocidade: | ||
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− | | | + | | <math>\frac{d [X]}{d\tau}= k_1 [A] [Y] - k_{2} [X] [Y] + k_{3} [A] [X] - 2k_{4} [X]^2 </math> |
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+ | | <math>\frac{d [Y]}{d\tau}= -k_1 [A] [Y] - k_{2} [X] [Y] + \frac{1}{2}f k_5 [B] [Z]</math> | ||
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+ | | <math>\frac{d [Z]}{d\tau}= 2k_{3} [A] [X] - k_5 [B] [Z] </math> | ||
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A análise é simplificada convertendo essas equações em uma forma adimensional: | A análise é simplificada convertendo essas equações em uma forma adimensional: | ||
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A partir de operações algébricas com as equações acima, obtemos para x, y e z, o seguinte sistema de equações diferenciais não lineares: | A partir de operações algébricas com as equações acima, obtemos para x, y e z, o seguinte sistema de equações diferenciais não lineares: | ||
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− | Onde <math>\epsilon \equiv \tfrac{k_{5}[B]}{ | + | |
− | , | + | <math> |
+ | \begin{cases} | ||
+ | \frac{dx}{dt} = \frac{qy - xy + x(1-x)}{\epsilon}\\ | ||
+ | \frac{dy}{dt} = \frac{-qy - xy + fz}{\epsilon '}\\ | ||
+ | \frac{dz}{dt} = x - z\\ | ||
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+ | Onde <math>\epsilon \equiv \tfrac{k_{5}[B]}{k_{3}[A]}</math>, <math> \epsilon ' \equiv \tfrac{2k_{4}k_{5}[B]}{k_{2}k_{3}[A]}</math> e <math>q \equiv \tfrac{2k_{4}k_{1}}{k_{2}k_{3}}</math>, e seus respectivos valores típicos são <math>\epsilon \approx 10^{-2}</math>,<math>\epsilon ' \approx 10^{-5}</math> e <math>q \approx 10^{-4}</math>. Como o parâmetro <math>\epsilon' \approx 10^{-5}</math> (que é obtido através de reações experimentais), é possível ver que y muda na escala do tempo de forma muito mais rápida que as demais variaveis, e então, assumimos que <math>y(h,t)</math> é sempre determinado pelos valores instantâneos de <math>x</math> e <math>z</math>, e assim, reescrevemos y como <math>y \equiv \tfrac{fz}{q+x}</math>:. Deste modo, as equações são reduzidas para <ref name=Oreg>http://www.scholarpedia.org/article/Oregonator#Eq-4</ref>: | ||
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: <math> \epsilon \frac{dx}{dt}= x(1-x) + f\frac{q-x}{q+x}z </math> | : <math> \epsilon \frac{dx}{dt}= x(1-x) + f\frac{q-x}{q+x}z </math> | ||
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: <math> \epsilon \frac{du}{dt}= u(1-u) + f\frac{q-u}{q+u}v + D_{u} \nabla^{2}u</math> | : <math> \epsilon \frac{du}{dt}= u(1-u) + f\frac{q-u}{q+u}v + D_{u} \nabla^{2}u</math> | ||
: <math>\frac{dv}{dt}= u-v + D_{v} \nabla^{2}v</math> | : <math>\frac{dv}{dt}= u-v + D_{v} \nabla^{2}v</math> | ||
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== Implementação == | == Implementação == | ||
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Como o código para Belousov-Zhabotinsky terá apenas 2 dimensões o <math> \Delta f(h,t) </math> ficará da seguinte forma: | Como o código para Belousov-Zhabotinsky terá apenas 2 dimensões o <math> \Delta f(h,t) </math> ficará da seguinte forma: | ||
:<math>\nabla^{2}f(h,t) = \frac{\partial^{2} f}{\partial x^{2}} + \frac{\partial^{2}f}{\partial y^{2}}</math> | :<math>\nabla^{2}f(h,t) = \frac{\partial^{2} f}{\partial x^{2}} + \frac{\partial^{2}f}{\partial y^{2}}</math> | ||
− | :<math>\nabla^{2}f(h,t) = \frac{f(x+dh,y,t)+f(x-dh,y,t)+f(x,y+dh,t)+f(x,y-dh,t)-4f(x,y,t)}{ | + | :<math>\nabla^{2}f(h,t) = \frac{f(x+dh,y,t)+f(x-dh,y,t)+f(x,y+dh,t)+f(x,y-dh,t)-4f(x,y,t)}{\Delta h^{2}} </math> |
De modo a simplificar a expressão para analises posteriores, reescreveremos desta forma, considerando uma analise 2D: | De modo a simplificar a expressão para analises posteriores, reescreveremos desta forma, considerando uma analise 2D: | ||
− | :<math>\nabla^{2}f(h,t) = \frac{f_{R}+f_{L}+f_{U}+f_{D}-4f_{C}}{ | + | :<math>\nabla^{2}f(h,t) = \frac{f_{R}+f_{L}+f_{U}+f_{D}-4f_{C}}{\Delta h^{2}} </math> |
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=== Aplicação dos Métodos para a Reação de Belousov-Zhabotinsky === | === Aplicação dos Métodos para a Reação de Belousov-Zhabotinsky === | ||
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− | :<math> \epsilon \frac{u_{ | + | :<math> \epsilon \frac{u_{C}^{n+1} - u_{C}^{n}}{\Delta t}= u_{C}(1-u_{C}) + f\frac{q-u_{C}}{q+u_{C}}v_{C} + D_{u} \left(\frac{u_{R}+u_{L}+f_{U}+u_{D}-4u_{C}}{\Delta h^{2}}\right)</math> |
− | :<math> u_{ | + | :<math> u_{C}^{n+1} - u_{C}^{n}= \left[u_{C}(1-u_{C}) + f\frac{q-u_{C}}{q+u_{C}}v_{C} + D_{u} \left(\frac{u_{R}+u_{L}+u_{U}+u_{D}-4u_{C}}{\Delta h^{2}}\right)\right]\frac{\Delta t}{\epsilon}</math> |
− | :<math> u_{ | + | :<math> u_{C}^{n+1} = u_{C} + \left[u_{C}(1-u_{C}) + f\frac{q-u_{C}}{q+u_{C}}v_{C} + D_{u} \left(\frac{u_{R}+u_{L}+u_{U}+u_{D}-4u_{C}}{\Delta h^{2}}\right)\right]\frac{\Delta t}{\epsilon}</math> |
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− | :<math> \frac{v_{ | + | :<math> \frac{v_{C}^{n+1} - v_{C}^{n}}{\Delta t}= u_{C}-v_{C} + D_{v} \left(\frac{v_{R}+v_{L}+v_{U}+v_{D}-4v_{C}}{\Delta h^{2}}\right) </math> |
− | :<math> v_{ | + | :<math> v_{C}^{n+1} - v_{C}^{n}= \left[ u_{C}-v_{C} + D_{v} \left(\frac{v_{R}+v_{L}+v_{U}+v_{D}-4v_{C}}{\Delta h^{2}} \right)\right] \Delta t </math> |
− | :<math> v_{ | + | :<math> v_{C}^{n+1} = v_{C} + \left[ u_{C}-v_{C} + D_{v} \left(\frac{v_{R}+v_{L}+v_{U}+v_{D}-4v_{C}}{\Delta h^{2}} \right)\right] \Delta t </math> |
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== Resultados == | == Resultados == | ||
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− | !colspan=" | + | !colspan="3"|Analise da concentração de u com <math>(e, q, f) = (0.2, 10^{-3}, 1)</math> <math>(D_u, D_v) = (10^{-5}, 10^{-5} )</math> |
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− | !colspan="2"|BZ com <math>(e, q, f) = (0.2, | + | !colspan="2"|BZ com <math>(e, q, f) = (0.2, 10^{-3}, 1)</math> <math>(D_u, D_v) = (10^{-5}, 10^{-5} )</math> |
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− | |[[Arquivo: | + | |[[Arquivo:U20k.gif|thumb|upright=4|none|alt=Alt text|BZ da concentração de <math> u </math> até t = 20k.|500px]] |
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− | + | [[Simulaçao Belousov-Zhabotinsky]] | |
== Referências == | == Referências == |
Edição atual tal como às 03h18min de 8 de abril de 2021
Índice
Belousov-Zhabotinsky Reaction
A reação de Belousov-Zhabotinsky[1] [2] (BZ) consiste em uma família de reações químicas oscilatórias descobertas inicialmente por Belousov, e posteriormente analisadas por Zhabotinsky. A reação consiste em 3BrO3− + 5CH2(CO2H)2 + 3H+ → 3BrCH(CO2H)2 + 4CO2 + 5H2O + 2CH2O2, e demonstra um comportamento oscilatório não linear até atingir o equilíbrio químico. A interação entre a reação e a difusão dos produtos químicos no espaço resultará na auto-organização de ondas viajantes dinâmicas. Seu mecanismo original, foi descrito através de 27 espécies químicas e um total de 80 reações.

Oregonator
Oregonator[2] é um modelo matemático utilizado para descrever de forma mais simples a dinâmica da reação BZ, desenvolvido por Field e Noyes (1974). Foi um modelo não espacial originalmente composto por três variáveis de estado, onde posteriormente, vemos que tornam-se apenas duas. O mecanismo é, inicialmente composto por cinco etapas irreversíveis, onde, A = 3BrO3 -, B = 5CH2(COOH)2; 2HCOOH, 3BrCH(COOH)2 (no geral, estas e demais espécies orgânicas); P = HOBr; X = HBrO2; Y = Br-; Z = forma oxidada do catalisador e f é o coeficiente estequiométrico. Observamos também. suas respectivas equações de taxa, onde v é a taxa da reação e ki corresponde às constantes de taxa de reação:
A + Y | ![]() |
X + P | v1 = k1 [A][Y] | ||||||||||||||||
X + Y | ![]() |
2 P | v2 = k2 [X][Y] | ||||||||||||||||
A + X | ![]() |
2 X + 2 Z | v3 = k3 [A][X] | ||||||||||||||||
2 X | ![]() |
A + P | v4 = k4 [X]2 | ||||||||||||||||
B + Z | ![]() |
![]() |
v5 = k5 [B][Z] |
Para construir o modelo Oregonator, é necessário supor que as concentrações de A e B permaneçam constantes (estão associadas às concentrações iniciais dos precursores). Posteriormente, deve-se aplicar as técnicas padrão de cinética química para obter o modelo dinâmico considerando X, Y e Z como variáveis dinâmicas, assumindo que as reações químicas são elementares, ou seja, os coeficientes estequiométricos coincidem com a potência das variáveis dinâmicas. Considerando como o tempo, vemos as seguintes equações de velocidade:
![]() |
![]() |
![]() |
A análise é simplificada convertendo essas equações em uma forma adimensional:
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
A partir de operações algébricas com as equações acima, obtemos para x, y e z, o seguinte sistema de equações diferenciais não lineares:
Onde ,
e
, e seus respectivos valores típicos são
,
e
. Como o parâmetro
(que é obtido através de reações experimentais), é possível ver que y muda na escala do tempo de forma muito mais rápida que as demais variaveis, e então, assumimos que
é sempre determinado pelos valores instantâneos de
e
, e assim, reescrevemos y como
:. Deste modo, as equações são reduzidas para [4]:
Dessa forma, o modelo de Oregonator mostra a forma típica de um sistema de feedback químico, ou seja, a variável x, que será reescrito como u, funciona como um ativador, enquanto a variável z, que será reescrita como v, tem o papel de inibidor. Se para as equações termos associados à difusão são adicionados, onde Du e Dv são os coeficientes de difusão adimensionais, e é o operador Laplaciano, então, o sistema torna-se:
Implementação
Antes de discretizarmos a equação para que assim possamos utiliza-la em um código, explicaremos brevemente métodos e fórmulas utilizados para isso.
Método FTCS (Forward Time Centered Space)[5]
De modo a resolver numericamente as equações descritas acima, serão utilizado o método FTCS (Forward Time Centered Space), que consiste em um método para resolver equações parciais através da derivada parcial de primeira ordem no tempo por uma diferença finita e progressiva e a derivada parcial de segunda ordem no espaço por uma diferença centrada, como vemos logo abaixo:
Laplaciano
O Laplaciano pode tanto ser representado por quanto por
.
O laplaciano é a soma de todas as derivadas parciais simples de segunda ordem:
Seja
Como o código para Belousov-Zhabotinsky terá apenas 2 dimensões o ficará da seguinte forma:
De modo a simplificar a expressão para analises posteriores, reescreveremos desta forma, considerando uma analise 2D:
Aplicação dos Métodos para a Reação de Belousov-Zhabotinsky
Considerando a equação :
Considerando a equação :
Resultados
Analise da concentração de u com ![]() ![]() | ||
---|---|---|
BZ com ![]() ![]() | |
---|---|
Programas Utilizados
Simulaçao Belousov-Zhabotinsky
Referências
- ↑ H. Sayama, "Introduction to the Modeling and Analysis of Complex Systems", p. 287. Open SUNY Textbooks, Geneseo, NY, 2015.
- ↑ 2,0 2,1 Harzola-Flores J.A., García E., Rojas J.F, Spatial and temporal dynamics of Belousov-Zhabotinsky reaction: A STEM approach (2020), Revista Mexicana de Física E 17 (2) 178–190
- ↑ https://gfycat.com/uk/discover/belousov-zhabotinsky-reaction-gifs
- ↑ http://www.scholarpedia.org/article/Oregonator#Eq-4
- ↑ https://pt.wikipedia.org/wiki/Esquema_FTCS